納濾技術在食品工業、飲料工業中應用比較多。主要用來對加工過程中的料液進行濃縮、脫鹽、調味、脫色、去除雜質等處理 。用能有效除去雜味和鹽味而不破壞原有的風味和營養成分。
可以進行脫脂牛奶的處理。該工藝可同時除去牛奶中的食鹽和對牛奶的濃縮，食鹽截留率約爲60%左右。研究瞭透過流速 、壓力 、溶液溫度 、溶液濃度對濃縮的影響，比較瞭納濾和反滲透的使用。結果表明，用納濾能有效地除去雜味和鹽味，且不破壞牛奶的風味，營養評價高於其它處理方法。Kubei等應用納濾膜進行瞭脫脂牛奶的處理，並對使用納濾膜和進行瞭比較：使用反滲透處理的乳，由於鹽類和乳糖都被濃縮，鹹昧和甜味都被增強 ，所以使乳的總體評價降低。而使用納濾膜，選擇适當的濃縮比進行處理 ，使得脫脂乳具有鹽類平衡的良好風味。研究結果表明，應用納濾還能有效地除去脫脂乳在儲藏過程中産生的各種不良氣味物質，且不破壞牛奶風味，營養價值也高於其他處理方法。
納濾膜技術還可以用於果汁濃縮 。果汁的濃縮傳統上是用蒸餾法或冷凍法濃縮，不僅能耗大，且導緻果汁風味和芳香成分的散失。用反滲透膜和納濾膜串聯起來進行果汁濃縮，以獲得更高濃度的濃縮果汁。應用這個技術進行各種果汁濃縮，可以保證果汁的色、香、味不變，也可節省大量能源，提高經濟效益。将反滲透與納濾連用，可得到40％的果汁濃縮液所需的能耗僅爲通常蒸餾法的八分之一或冷凍法的五分之一，使用前景非常廣泛。
